香格里拉地处青藏高原东南缘横断山脉三江纵谷区东部,沙鲁里山脉由四川甘孜入县境,分两支将县境东西两侧包围,金沙江从土照壁进入县境,南流至金江乡撒苏碧与丽江石鼓之间,突转向东北,至洛吉吉函流入四川坪子了境,将县境南部包围。香格里拉成为两头窄,中间宽,“雪山为城,金沙为池”的雄伟太势。县境地形总趋势西北高、东南低,最高点巴拉格宗海拔5545米,最低点洛吉吉函海拔1503米,海拔高差4042米,平均海拔3459米,县境地貌按形态可分为山地、高原、盆地、河谷。
香格里拉产区气候,海拔3000~4000米,年平均气温5.4℃,极端最高气温为24.9℃,极端最低气温为-25.4℃,7月平均气温为13.2℃,12月至翌年2月平均气温为-1.5~3.7℃,≥10℃积温为1398.7℃。无霜期128天,年降水量620毫米,年蒸发量1713.4毫米,年平均相对湿度为70%。年平均降雪日为24.8天。草场属高山草甸草场,植被盖度在85%以上。草场水源丰富,7~9月间牧草高度为20~35厘米。海拔4000~4500米为高山苔原及高山冰漠带,植被为高山杜鹃灌丛、高山嵩草等,是牦牛的夏季牧场。